Американским Управлением по продуктам и лекарствам (FDA) при участии Калифорнийского университета в Дэвисе и компании Agilent Technologies запущен проект «100 000 геномов», публикует GenomeWeb Daily News.

В ряду исполнителей проекта Американские Центры по контролю и предупреждению заболеваний (CDС), а также Минсельхоз.

Проект предполагает расшифровку геномов целевых микроорганизмов с применением новейшей «Технологии секвенирования нового поколения», отличающуюся высокой пропускной способностью и достоверностью. Значительную часть взятых бактериальных геномов представят в виде черновых вариантов, сопоставляемых с выбранными полногеномными референсными последовательностями. Цель подобного анализа — обнаружение генетических маркеров, взаимосвязанных с конкретными значимыми патогенными признаками.

Программа запланирована на 5 лет, полученная информация будет передана в открытую базу данных Наццентра биотехнологической информации при Нацинститутах здоровья (Бетесд). По информации представителей Университета Калифорнии, речь идет, прежде всего, о геномах патогенов Salmonella, Escherichia coli, Listeria.

Вместе с получением 100 000 геномов бактерий и вирусов будет разработана «дорожная карта», позволяющая создавать тесты для определения патогенов и устанавливать их природу быстрее, нежели это делается сегодня. Применение подобной базы данных, позволит ученым создать новые методы регулирования размножения вредных бактерий в пищевой цепи.

Руководит проектом Барт Веймер — профессор факультета ветеринарии Университета Калифорнии (г. Дэвис).

Веймер считает, что обусловленность живучести микробных патогенов и их способности проникать в пищевую цепь генетической пластичностью, позволяющей им приспосабливаться к любому окружению, становится все более ясной. Недостаток информации о геномах бактерий, относящихся к продуктам питания, не дает ученым возможность гарантировать людям безопасное питание.

По мнению Барта Веймера, данные проекта «100 000 геномов» позволят сделать диагностические тесты оперативными, точными, экономичными.

Предполагаемое проектом секвенирование будет проведено в Университете Калифорнии, заключившем в прошлом году соглашение о совместном проведении масштабных работ по чтению ДНК и функциональной геномике с Институтом геномики в Пекине.

FDA готово предоставить тысячи штаммов пищевых патогенов, свыше 500 полногеномных «черновых» последовательностей ДНК сальмонеллы, биоинформатическую поддержку. CDC проведет экспертизу патогенов, передаваемых с водой и пищей, чьи геномы необходимо расшифровать.

Следующая новость: До ста лет чаще доживают родившиеся осенью
Предыдущая новость: Бежевый жир действительно существует